Diplômé de l’Institut d’études politiques de Paris, ancien élève de l’Ecole normale supérieure de la rue d’Ulm et de l’ENA, Frédéric Mion a débuté sa carrière en intégrant le Conseil d’Etat en 1996 comme auditeur puis maître des requêtes.
En 2000, il rejoint le ministère de l’Education nationale comme conseiller au cabinet du ministre, puis, en 2001, celui de la fonction publique, comme adjoint au Directeur général de l’administration et de la fonction publique.
Il devient avocat en 2003 au sein du cabinet Allen et Overy LLP.
En 2007, il rejoint le groupe Canal+ en tant que Secrétaire général, fonction qu’il occupe jusqu’en 2013. Il est élu cette année-là directeur de Sciences Po et exerce cette fonction pendant huit ans, avant de réintégrer le Conseil d’Etat en 2021.